醫(yī)院前身虹橋療養(yǎng)院創(chuàng)建于 1934 年，1958 年與 1938 年創(chuàng)建的怡和醫(yī)院合并，命名為上海市淮海醫(yī)院，1961年正式更名為上海市徐匯區(qū)中心醫(yī)院，擁有悠久的歷史文化傳承，2020 年 7 月經(jīng)上海市衛(wèi)生健康委員會批準(zhǔn)為三級乙等綜合性公立醫(yī)院。醫(yī)院核定床位588 張，實際開放床位 836 張。在崗職工 1,400 余人，其中碩博人員 300 余人，高級職稱人員近 200人。擁有享受國務(wù)院特殊津貼專家 6 人，上海市領(lǐng)軍人才 2 人，上海市區(qū)域名醫(yī) 2 人。

醫(yī)院是上海市首批「區(qū)域醫(yī)療中心」建設(shè)單位、第四屆全國文明單位。心血管內(nèi)科和康復(fù)科連續(xù)六屆入選上海市醫(yī)學(xué)重點?？平ㄔO(shè)計劃；呼吸內(nèi)科入選上海市醫(yī)學(xué)重點?？婆嘤ㄔO(shè)計劃；針灸科是國家中醫(yī)藥管理局「十一五」、「十二五」重點專科；中醫(yī)腦病科是上海市中醫(yī)臨床重點建設(shè)學(xué)科，并列入上海市中醫(yī)?？婆嘤ㄔO(shè)計劃；神經(jīng)康復(fù)是上海市殘聯(lián)重點學(xué)科；醫(yī)院還是上海市衛(wèi)生系統(tǒng)重要薄弱學(xué)科單位（急診科、精神科）及上海市臨床藥學(xué)重點?？平ㄔO(shè)項目單位（藥劑科）。消化內(nèi)鏡、普通外科、呼吸科、神經(jīng)內(nèi)科、血液科、腎內(nèi)科為徐匯區(qū)尖峰高峰高原學(xué)科。醫(yī)院聚焦重點學(xué)科建設(shè)，葛均波院士工作站、張旭院士工作站、蔣華良院士工作站、「大國工匠」周平紅內(nèi)鏡工作站相繼落地醫(yī)院?！竾倚赝粗行摹?、「中國心臟康復(fù)中心」、「腦卒中中心」先后通過國家認(rèn)證。院士、大國工匠工作站帶動了學(xué)科全面發(fā)展，心血管內(nèi)科在葛均波院士及團(tuán)隊專家引領(lǐng)下學(xué)科影響力全面提升，心血管手術(shù)數(shù)量大幅上升。

醫(yī)院 2010 年成為中國科學(xué)院上海藥物所臨床研究中心；2013 年成為中國科學(xué)院上海臨床研究中心。2016年徐匯區(qū)-中山醫(yī)院醫(yī)療聯(lián)合體正式成立，「復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院徐匯醫(yī)院」掛牌，由此開啟區(qū)域內(nèi)各級醫(yī)療機構(gòu)全方位醫(yī)療聯(lián)合。2019 年 2 月，復(fù)旦大學(xué)附屬徐匯醫(yī)院（籌）正式掛牌，醫(yī)院迎來了發(fā)展的新機遇，醫(yī)院以籌建工作為契機，加強教學(xué)、科研及人才高地建設(shè)，打造新型優(yōu)勢學(xué)科，引領(lǐng)學(xué)科發(fā)展。

醫(yī)院作為上海中醫(yī)藥大學(xué)、河西學(xué)院、南通大學(xué)、江蘇大學(xué)等多所醫(yī)學(xué)院校的教學(xué)醫(yī)院，也是新疆醫(yī)科大學(xué)研究生教學(xué)基地，上海健康醫(yī)學(xué)院、蚌埠醫(yī)學(xué)院院校實習(xí)點，并為中國科學(xué)院上海臨床研究中心與上海大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)碩士研究生；承擔(dān)上海體育學(xué)院、重慶醫(yī)科大學(xué)研究生培養(yǎng)任務(wù)。目前擁有6 個市級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地，建立德才兼?zhèn)?、素質(zhì)優(yōu)良、結(jié)構(gòu)合理的優(yōu)質(zhì)師資隊伍。

醫(yī)院是國家藥物臨床試驗機構(gòu)（GCP）, 設(shè)有新藥研究國家重點實驗室徐中心分實驗室、上海藥物 I 期臨床暨藥物一致性評價工程技術(shù)研究中心。醫(yī)院于2006 年獲得 GCP 資質(zhì)，系當(dāng)時最早獲得 GCP 資質(zhì)的二甲醫(yī)院之一，目前設(shè)置有 10 個藥物臨床試驗專業(yè)組，承擔(dān)藥物、器械等研究項目290 余項，有多個藥物、器械獲得了上市許可；I 期臨床專業(yè)設(shè)有 141 張臨床專用床位，實施了 31 個創(chuàng)新藥物的 I期臨床研究，并有兩個項目通過了 WHO 的 GCP 和 GLP 項目認(rèn)可，是目前上海市醫(yī)療機構(gòu)中擁有專用的 I 期臨床研究床位最多的醫(yī)院。

醫(yī)院擁有 2000 余臺醫(yī)療專業(yè)設(shè)備，其中百萬元以上設(shè)備 79 臺，包括 PET-CT、D-SPECT、SPET、核磁共振、DSA、64 排螺旋 CT，高清腹腔鏡、胃腸鏡、胸腔鏡，磁控膠囊胃鏡，聚焦超聲治療系統(tǒng)等先進(jìn)的臨床診療設(shè)備。

近五年來，醫(yī)院獲各級各類科研立項 240 項，其中省市級以上科研課題 72 項（國家級項目 17 項、吳階平醫(yī)學(xué)基金會項目 3項）；發(fā)表學(xué)術(shù)論文 793 篇（SCI 收錄 162 篇）；獲市局級以上獎勵 18 項，主編參編著作 33部，法文版《智慧醫(yī)療在中國上海的實踐》在法國出版發(fā)行；授權(quán)專利 20 項（發(fā)明專利 10 項、實用新型專利 10 項）。

「上海徐匯云醫(yī)院」是上海首家互聯(lián)網(wǎng)+AI 醫(yī)院，獲批上海市首個公立醫(yī)院醫(yī)療、醫(yī)保、商?！溉普铡梗_創(chuàng)了新型醫(yī)療健康服務(wù)模式。自 2015 年12 月運行以來，醫(yī)療健康服務(wù)人次達(dá)到 240 余萬人次。將醫(yī)療服務(wù)從上海、江蘇輻射至西藏、云南等 20 個省市，觸角從街道、居委延伸至居民個人，為人民群眾提供便捷、經(jīng)濟(jì)、規(guī)范、安全的新型醫(yī)療健康服務(wù)。