南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院是江西省最早開展器官移植工作的醫(yī)療機(jī)構(gòu)之一，分別在 1993 年開展腎移植、2000 年開展肝移植、2002 年開展心臟移植。

2010 年 10 月成為全國首批 DCD 來源的器官移植試點(diǎn)建設(shè)單位，2011 年 6 月成為心臟死亡捐獻(xiàn)器官移植試點(diǎn)單位。2014 年 3月 3 日成立器官移植科，并創(chuàng)建了器官獲取組織（OPO）。2014 年 7 月 8 日，醫(yī)院及 OPO取得中國人體器官分配與共享系統(tǒng)（COTRS）認(rèn)證并開通賬戶，器官移植科按國家開展人體器官移植的診療技術(shù)規(guī)范和要求，進(jìn)行病區(qū)建設(shè)和人員培訓(xùn)，共有醫(yī)護(hù)人員25 人，其中移植組 21 人，專職器官捐獻(xiàn)協(xié)調(diào)員 4 人，擁有床位數(shù) 35 張，設(shè)置移植 ICU（床位數(shù) 6 張），配置人工肝、持續(xù)性血液凈化、ECMO、Lifeport、轉(zhuǎn)運(yùn)呼吸機(jī)、便攜式彩超、便攜式腦功能判定儀等所有器官捐獻(xiàn)與移植必須擁有的設(shè)備。制定了《南昌大學(xué)二附院器官捐獻(xiàn)與移植工作手冊(cè)》，手冊(cè)包含器官捐獻(xiàn)與移植的法規(guī)、制度、職責(zé)、標(biāo)準(zhǔn)、技術(shù)規(guī)范和質(zhì)量控制。

2014 年 11 月 29 日開始實(shí)施公民逝世后捐獻(xiàn)器官的肝臟、腎臟移植手術(shù)， 2015 年 3 月 24日按國家衛(wèi)計(jì)委要求暫停器官移植手術(shù)繼續(xù)開展 OPO 工作，期間共完成腎臟移植 22 例，肝臟移植 1 例，并取得良好的臨床效果。2015年初省衛(wèi)計(jì)委向國家衛(wèi)計(jì)委申報(bào)南昌大學(xué)二附院肝臟、腎臟移植手術(shù)資質(zhì)，經(jīng)國家衛(wèi)計(jì)委初步審核，于 2017 年 4 月 11日，國家衛(wèi)計(jì)委醫(yī)政醫(yī)管局組織以鄭樹森院士為組長的專家組對(duì)醫(yī)院進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)評(píng)審，評(píng)審結(jié)果完全符合中國人體器官移植手術(shù)資質(zhì)準(zhǔn)入的標(biāo)準(zhǔn)，全票通過。2018年 1 月 16 日，國家衛(wèi)計(jì)委發(fā)文認(rèn)定醫(yī)院具備肝臟移植、腎臟移植手術(shù)資質(zhì)，成為我國具有器官移植手術(shù)資質(zhì)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)新成員。